DynamicBind 蛋白质动态复合物结构预测数据集

日期

4 个月前

大小

2.53 GB

机构

上海交通大学
中山大学

发布地址

github.com

该数据集是论文「DynamicBind: predicting ligand-specific protein-ligand complex structure with a deep equivariant generative model」的训练集和测试集,该论文是上海交通大学郑双佳课题组联合星药科技、中山大学药学院以及美国莱斯大学发布的,研究团队提出了为蛋白质「动态对接」设计的几何深度生成模型 DynamicBind , 可以有效地将蛋白质构象从最初的 AlphaFold 预测调整到类似全息的状态,为后 AlphaFold 时代的药物研发提供了一种基于深度学习的、考虑蛋白动态变化的新研究范式。

论文中使用的原始数据来源于公共数据集 PDbbind2020,在这项研究中产生的研究数据和经过处理的训练数据可在当前页面获取下载。

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