TandemMod 迁移学习模型研究使用的数据集

该数据集包含了「Transfer learning enables identification of multiple types of RNA modifications using nanopore direct RNA sequencing」研究所使用的相关数据集，每个文件都有对应的编码，具体内容如下：

本研究中使用的已发表的 DRS 数据集来自美国国家生物技术信息中心 (NCBI) Novoa 实验室的工作，编号为 GSE124309 、 PRJNA563591 ，以及 Intawat Nookaew 的工作，编号为 SRP166020 （本数据集中暂未提供）。

本研究中使用的几种人类细胞系的 DRS 数据可从新加坡纳米孔表达项目公开获得，可在欧洲核苷酸档案馆 (ENA) 下获得，编号为 PRJEB44348 （本数据集中暂未提供）。水稻 m ⁶ A-seq 数据来自基因表达综合数据库 (GEO)，编号为 GSE135549 。人类 HEK293T 细胞系的 m6ACE-Seq 和 miCLIP 数据可在 GEO 数据库中获得，编号分别为 GSE124509 和 GSE63753 。人类 K562 细胞系的 MeRIP-seq 可在 GEO 数据库中查阅，编号为 GSE205709 。四个体外表观转录组 (IVET) 数据集、两个来自合成序列的 IVT 数据集和两个由 ONT 直接 RNA 测序生成的水稻数据集已存入 GEO 数据库，编号为 GSE227087 。