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DRfold2 RNA構造テストデータセット

日付

7ヶ月前

組織

シンガポール国立大学
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※本データセットはオンライン利用に対応しておりますが、ここをクリックしてジャンプしてください

DRfold2データセットは、シンガポール国立大学の張楊教授のチームによって2025年に作成されました。関連論文のタイトルは「最初から 複合言語モデルとノイズ除去エンドツーエンド学習によるRNA構造予測このデータセットは、本研究における DRfold2 のパフォーマンスを客観的に評価するために構築された独立したテスト データセットです。

これには、配列長が 400 nt 未満で、次の 3 つのカテゴリに属する 28 個の RNA 構造が含まれています。

  • 最新のRNAパズルのターゲット配列
  • CASP15競合におけるRNA標的配列
  • 2024年8月1日現在、タンパク質データバンク(PDB)データベースに最近公開されたRNA構造

注目すべきことに、研究者らは、機能解析と医薬品設計の主な焦点である自然界で発見されたRNA構造から逸脱しているという理由で、大規模な合成RNA構造をCASP15データセットから除外した。

厳密なモデル評価を確実に行うために、トレーニング セットには 2024 年以前に公開された RNA 構造のみが含まれ、テスト データセットとの配列類似性が 80% を超える RNA は除外されます。

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