Inocras dévoile un modèle fondamental du cancer entraîné sur des milliers de génomes complets SAN DIEGO – (BUSINESS WIRE) – Inocras, entreprise spécialisée en bioinformatique et dédiée à l’exploitation des données de génome complet pour améliorer la santé personnalisée, annonce aujourd’hui la mise au point d’un modèle fondamental révolutionnaire en oncologie, entraîné sur 2 882 génomes complets provenant de divers types de cancers. Ce progrès majeur, réalisé en collaboration avec l’Institut de technologie avancée de Corée (KAIST), ouvre la voie à une application plus poussée de l’intelligence artificielle dans l’oncologie de précision. Le modèle repose sur une approche novatrice combinant une tokenisation apprenable et un cadre d’encodage sensible au cancer, qui intègre diverses caractéristiques génomiques pour produire des représentations au niveau du patient. Ce processus permet de capter les motifs moléculaires sous-jacents à la biologie tumorale et aux issues cliniques. Au cœur de cette avancée se trouve DNAChunker, un modèle propriétaire basé sur une architecture hiérarchique dynamique en H-Net, capable de découper les séquences d’ADN de manière adaptative. Contrairement aux méthodes classiques qui traitent l’ADN par segments fixes, DNAChunker se concentre sur les régions à fort signal biologique tout en compressant les zones à faible information, optimisant ainsi à la fois la précision et l’efficacité computationnelle. Le résultat est un modèle d’avant-garde, profondément ancré dans la biologie, qui atteint des performances supérieures avec moins de paramètres et une consommation énergétique réduite. Dans des évaluations comparatives sur des tâches de représentation génomique et de prédiction fonctionnelle, le modèle dépasse les meilleurs modèles existants, tels que Nucleotide Transformer et DNABERT-2. Lorsqu’il a été testé pour sa pertinence clinique en agrégeant les embeddings de mutations générés par DNAChunker à partir de près de 3 000 génomes de cancers, il a atteint une précision de 98 % pour la prédiction du défaut de réparation de l’ADN (HRD) et de 84 % pour la classification des sous-types PAM50 à partir de données ADN seules, sur des jeux de données indépendants. Il s’agit ainsi d’un des premiers liens directs établis entre un modèle fondamental basé sur l’ADN et des indicateurs biologiques cliniquement significatifs. « Cela marque un tournant décisif vers une génomique cancéreuse intégralement conçue pour l’IA, interprétable et cliniquement pertinente », déclare Jehee Suh, PDG d’Inocras. « Nous passons de la simple séquençage des génomes à leur véritable compréhension. C’est là que l’IA transforme l’oncologie. C’est à ce moment que les données deviennent un diagnostic, et que les insights génomiques commencent à façonner réellement les soins aux patients. » La recherche d’Inocras sera présentée prochainement à la conférence EMBL de génomique du cancer à Heidelberg, en Allemagne. Young Seok Ju, Ph.D., co-fondateur d’Inocras et l’un des organisateurs de l’événement, présentera le 11 novembre à 16h15 (CET) une communication intitulée « Un modèle fondamental du cancer à partir de 1 364 génomes complets de cancers du sein pour la stratification des patients », mettant en lumière les résultats issus d’un cohort de 1 364 patients et montrant comment le modèle fondamental génomique piloté par DNAChunker permet une stratification des patients et la découverte de sous-types moléculaires par l’IA. Ce modèle fondamental marque une avancée significative vers une stratification des patients basée sur des représentations génomiques, renforçant ainsi la position d’Inocras en tant que pionnier des diagnostics de précision de nouvelle génération. À propos d’Inocras Inocras est une entreprise bioinformatique qui redéfinit la santé personnalisée grâce à l’analyse des génomes complets et à des outils analytiques propriétaires. Ses plateformes oncologiques et pour les maladies rares intègrent des données génomiques complètes avec une automatisation avancée pour fournir des insights précis et exploitables à grande échelle, accélérant ainsi la découverte et le diagnostic afin d’améliorer les soins aux patients. Inocras exploite un laboratoire certifié CLIA/CAP et collabore avec des hôpitaux, des entreprises pharmaceutiques et des institutions de recherche de renom à travers le monde. Pour plus d’informations, rendez-vous sur inocras.com ou suivez Inocras sur LinkedIn.