Google Antigravity: agents IA pour la chimio-informatique

Google présente de nouvelles compétences en chimiointelligence intégrées à Google Antigravity, destinées à accélérer le travail des chimistes computationnels et expérimentaux. Ces modules transforment la plateforme en un véritable espace de travail scientifique collaboratif, capable de traiter des données moléculaires hétérogènes et de coordonner des outils spécialisés. L’initiative vise à réduire le temps consacré au nettoyage et à l’organisation des données, afin que les chercheurs puissent se concentrer davantage sur la formulation d’hypothèses et l’interprétation des résultats. La chimie dispose d’un volume considérable de données publiques, issues d’articles scientifiques, de brevets et de catalogues de fournisseurs. Or, une même molécule peut être représentée de multiples manières, par exemple comme un nom, une image, une structure brevet ou un fichier de données. Cette diversité complique la recherche et l’analyse, car une erreur sur un seul atome ou une seule liaison peut conduire à décrire une autre substance. Les outils développés par Google doivent donc unifier ces sources tout en limitant les risques d’erreurs. L’architecture repose sur une répartition des rôles entre le modèle linguistique sous-jacent et des outils chimiques déterministes. Le modèle assure l’orchestration du travail, la navigation dans les bases de données et le raisonnement scientifique, tandis que les outils exécutent des calculs moléculaires plus précis et reproductibles. Cette approche s’appuie sur RDKit, une bibliothèque open source de chimiointelligence développée par une communauté mondiale, ainsi que sur des connecteurs vers des ressources curatées comme ChEMBL et PubChem. Des pratiques de référence du domaine sont ainsi intégrées directement dans le fonctionnement de l’assistant. L’article met en avant un exemple issu de la chimie médicinale : la rigidification moléculaire, une technique utilisée pour améliorer l’efficacité de médicaments. Les molécules thérapeutiques peuvent posséder plusieurs liaisons rotatives, ce qui leur permet d’adopter de nombreuses formes en trois dimensions. Cette souplesse peut diminuer la force de liaison avec la cible biologique, car la molécule doit adopter une conformation précise pour se fixer. En ajoutant une nouvelle liaison, les chimistes peuvent limiter cette liberté de mouvement et forcer la molécule à se présenter dans la forme la plus favorable. Cette stratégie, parfois décrite comme le paiement anticipé d’un coût entropique, peut améliorer notablement l’activité d’un composé. Le cas illustré concerne deux inhibiteurs de tyrosine kinase utilisés dans certains cancers du poumon non à petites cellules. Le crizotinib, médicament de première génération, possède cinq liaisons rotatives principales. Le lorlatinib, un composé plus récent, s’en rapproche mais a été cyclisé à son extrémité afin de réduire à zéro le nombre effectif de liaisons rotatives, ce qui contribue notamment à une meilleure puissance d’action. Dans cette démonstration, l’assistant retrouve en quelques minutes plusieurs milliers de composés, élimine les molécules non pertinentes comme les tampons ou les solvants et documente l’origine des résultats dans un rapport. Le rapport peut aussi fournir une première analyse, en signalant par exemple que les macrocycles identifiés sont majoritairement prédits comme pouvant pénétrer dans le cerveau, une propriété utile dans le contexte de métastases cérébrales liées à ce type de cancer. Ces compétences en chimiointelligence sont mises à disposition dans Google Antigravity via l’application et le plugin Science. Elles sont également accessibles aux utilisateurs d’entreprise, qui peuvent se connecter avec leur compte professionnel et leurs identifiants Google Cloud. Pour soutenir la recherche, Google propose en outre à dix mille scientifiques l’accès gratuit pendant six mois à l’offre d’usage la plus élevée de Google Antigravity, sous conditions d’éligibilité, de capacités disponibles et de sélection. Les demandes sont ouvertes et l’intégration se fait de manière progressive.