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Freenome et NVIDIA s’allient pour accélérer la détection précoce du cancer grâce à l’IA et un modèle fondamental open-source en biologie des fragments d’ADN libre dans le sang

Freenome a annoncé l’extension de ses initiatives en intelligence artificielle et apprentissage profond, accélérées par NVIDIA, dans le cadre de son programme de détection précoce du cancer par analyse sanguine. Cette collaboration vise à améliorer la vitesse et la précision de l’analyse des signaux biologiques du cancer à ses stades les plus précoces, grâce à des technologies d’informatique accélérée. Freenome exploite une plateforme multi-omique qui analyse l’ADN méthylé, l’ARN, les protéines et d’autres molécules présentes dans le sang, générant des milliards de données par individu. L’intelligence artificielle et l’apprentissage automatique sont essentiels pour identifier les motifs spécifiques au cancer dans ces données complexes. Grâce à NVIDIA, Freenome va intensifier l’entraînement de ses modèles d’apprentissage profond à l’échelle des fragments d’ADN libre de cellules (cfDNA), appelés modèles FLDL (Fragment-Level Deep Learning), qui ont déjà démontré une performance supérieure aux méthodes d’apprentissage machine actuelles. Ces modèles sont particulièrement efficaces lorsqu’ils sont entraînés sur de grands volumes de données, comme ceux générés par une simple prise de sang. NVIDIA aide à surmonter les goulets d’étranglement liés au chargement des données et à la mémoire, permettant ainsi une évolution rapide des modèles face à l’expansion des tests et des données. Parmi les projets clés de la collaboration figure la création d’un modèle fondamental open-source dédié au cfDNA. Ce modèle, développé avec le cadre BioNeMo de NVIDIA, sera capable d’interpréter les motifs de méthylation spécifiques au cfDNA, ouvrant la voie à diverses applications, notamment la détection précoce du cancer. Freenome intégrera ses données propriétaires avec des données publiques pour construire ce modèle, qu’il rendra accessible gratuitement à la communauté scientifique. Par ailleurs, Freenome s’engage à soutenir les organisations de santé (HCO) en leur offrant des outils accélérés pour analyser des données cliniques et moléculaires dépersonnalisées, issues de données du monde réel (RWD) collectées lors de ses essais cliniques. Cette initiative vise à renforcer la recherche en diagnostic, pronostic et autres applications futures, en permettant aux établissements de santé d’exploiter efficacement ces données grâce à l’IA. SimpleScreen™ CRC, le premier test sanguin de Freenome pour le cancer colorectal, est actuellement soumis à l’approbation par la FDA, avec une décision attendue dans la seconde moitié de 2026. L’entreprise prévoit également le lancement de plusieurs autres tests pour d’autres types de cancer, dont le cancer du poumon, en 2026, via un workflow laboratoire automatisé commun. En tant que pionnière dans la détection précoce du cancer, Freenome repose sur une approche multi-omique combinée à l’IA pour détecter les signes les plus subtils du cancer, même avant qu’il ne devienne symptomatique. Cette collaboration avec NVIDIA renforce sa capacité à transformer les données biologiques complexes en outils cliniques puissants, avec un impact potentiel à grande échelle sur la santé publique. Évaluation : Selon des experts en bioinformatique, cette collaboration représente une avancée significative dans l’application de l’IA aux diagnostics de cancer. Le développement d’un modèle fondamental open-source pourrait accélérer la recherche dans le domaine du cfDNA, tout en favorisant la transparence et la collaboration scientifique. NVIDIA, déjà leader dans les infrastructures d’IA pour la biologie, renforce sa position comme partenaire stratégique pour les entreprises de santé innovantes. Freenome, avec son approche intégrée et son engagement envers l’open science, se positionne comme un acteur clé dans la prochaine génération de dépistage du cancer.

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