Le Cancer Research Institute (CRI) a lancé une initiative révolutionnaire en immuno-oncologie pilotée par l’intelligence artificielle, en collaboration avec 10x Genomics. Ce projet pluriphases vise à produire des données à l’échelle unique, à la fois au niveau cellulaire unique et spatial, à partir de plus de 20 000 échantillons issus de laboratoires de pointe en immuno-oncologie. L’objectif est de cartographier en détail le paysage immunitaire du cancer, afin d’accélérer le développement de nouvelles immunothérapies et de vaccins anticancéreux. La phase initiale, soutenue par des chercheurs de renommée mondiale comme John Wherry (Université de Pennsylvanie), Ansuman Satpathy (Stanford University) et Andrea Schietinger (Memorial Sloan Kettering), prévoit la génération de 3 000 échantillons analysés grâce aux plateformes Chromium (cellule unique) et Xenium (spatiale) de 10x Genomics. Ces outils ont été choisis pour leur capacité à produire des données de haute qualité, à grande échelle, avec une résolution et une cohérence optimales, essentielles pour l’entraînement d’algorithmes d’IA. Les données issues de cette phase pilote serviront à valider des modèles préliminaires d’IA et à identifier les caractéristiques cellulaires et du microenvironnement les plus prédictives en contexte préclinique. La phase suivante s’étendra à un réseau plus vaste de laboratoires, avec l’adoption de la plateforme Chromium Flex, conçue pour des études à ultra-haute densité, permettant d’analyser plus de 500 millions de cellules. L’ensemble du jeu de données intégré devrait révéler les mécanismes d’action et de résistance immunitaires, permettant d’optimiser les traitements existants, de découvrir de nouvelles cibles thérapeutiques et de poser les bases de la conception de vaccins préventifs contre le cancer. Cette initiative s’inscrit dans la vision du CRI de renforcer les trois piliers de son action : les personnes, la biologie et les données. En combinant la technologie de pointe de 10x Genomics avec le réseau mondial de recherche du CRI, le projet vise à créer une cartographie immunitaire sans précédent, capable de transformer la prévention et le traitement du cancer. Selon Alicia Zhou, PDG du CRI, cette collaboration matérialise une avancée décisive dans la mission du CRI : construire une « carte immunitaire » à haute résolution qui redéfinira la manière dont le cancer est compris et combattu. Serge Saxonov, PDG et co-fondateur de 10x Genomics, souligne que la compréhension fine de la biologie cellulaire, dans son contexte spatial et à grande échelle, est essentielle pour déchiffrer les mécanismes de réponse aux traitements et construire les fondations scientifiques des prochaines générations d’immunothérapies et de vaccins. Ce projet s’inscrit dans l’héritage du CRI, qui a joué un rôle clé dans le développement du vaccin Gardasil® contre le HPV, l’un des premiers vaccins anticancéreux préventifs. Il marque une nouvelle étape dans sa mission visant un monde immunisé contre le cancer, en accélérant la découverte de traitements efficaces pour toutes les formes de cancer. Évaluation : Cette initiative représente une avancée majeure dans l’intégration de la biologie à haute résolution, de l’intelligence artificielle et de la recherche translationnelle. Les experts saluent la synergie entre la capacité technologique de 10x Genomics et l’expertise scientifique du CRI. Le projet pourrait non seulement révolutionner la recherche en immuno-oncologie, mais aussi servir de modèle pour d’autres initiatives en biologie complexe. La mise en œuvre à grande échelle, combinée à une analyse par IA, soulève toutefois des défis en matière de standardisation des données, de confidentialité et d’interprétabilité des modèles. Toutefois, si les objectifs sont atteints, cette initiative pourrait marquer un tournant dans la lutte contre le cancer.