Paragraphe — Prédiction du paratope d'anticorps à l'aide de réseaux neuronaux graphes avec des vecteurs de caractéristiques minimaux

Résumé : Le développement de nouveaux vaccins et de thérapeutiques à base d'anticorps nécessite généralement plusieurs années et un investissement dépassant 1 milliard de dollars. Une connaissance précise du paratope (site de liaison de l'anticorps) peut accélérer et réduire les coûts de ce processus en améliorant notre compréhension de l'interaction entre anticorps et antigènes. Nous présentons Paragraph, un outil de prédiction du paratope basé sur la structure, qui surpasser les outils actuels de pointe en utilisant des vecteurs de caractéristiques plus simples et sans information sur l'antigène. Disponibilité et mise en œuvre : Le code source est librement disponible à l’adresse www.github.com/oxpig/Paragraph. Contact : [email protected]. Informations complémentaires : Les données supplémentaires sont disponibles sur le site de Bioinformatics.