Dans cet article, nous présentons notre participation à la tâche Bacteria Biotope (BB) au concours BioNLP-OST 2019. Notre système exploite des modèles de représentation linguistique fine-tunés ainsi que des approches d'apprentissage automatique basées sur des embeddings de mots et des caractéristiques lexicales pour la reconnaissance d'entités, la normalisation et l'extraction de relations. Il atteint des performances de pointe et se classe parmi les deux meilleurs systèmes pour cinq des six sous-tâches.