La bibliothèque WaveForm DataBase (WFDB) pour MATLAB/Octave permet un accès intégré au logiciel et aux bases de données de PhysioNet. Grâce à cette bibliothèque, les utilisateurs ont accès à plus de 50 bases de données physiologiques disponibles sur PhysioNet. La toolbox offre un accès à plus de 4 téraoctets de signaux biomédicaux, notamment des ECG, EEG, EMG et PLETH. En outre, la plupart de ces signaux sont accompagnés de métadonnées, telles que des annotations médicales d’événements cliniques : arythmies, stades du sommeil, crises épileptiques, épisodes d’hypotension, etc. Les utilisateurs de cette toolbox peuvent ainsi facilement reproduire, valider et comparer les résultats publiés sur la base du logiciel et des bases de données de PhysioNet.