Ensembles De Données Utilisés Dans La Recherche Sur Le Modèle D'apprentissage Par Transfert TandemMod

Cet ensemble de données contientL'apprentissage par transfert permet l'identification de plusieurs types de modifications d'ARN à l'aide du séquençage direct de l'ARN par nanopores« Les ensembles de données pertinents utilisés dans la recherche, chaque fichier a un code correspondant, le contenu spécifique est le suivant :

L'ensemble de données DRS publié utilisé dans cette étude provient des travaux du laboratoire Novoa du National Center for Biotechnology Information (NCBI), États-Unis, sous le numéro GSE124309 , PRJNA563591 , et les travaux d'Intawat Nookaew, no. SRP166020 (Non disponible dans cet ensemble de données pour le moment).

Les données DRS pour plusieurs lignées cellulaires humaines utilisées dans cette étude sont accessibles au public auprès du Singapore Nanopore Expression Project et sont disponibles auprès des Archives européennes des nucléotides (ENA) sous le numéro d'accès PRJEB44348 (Non disponible dans cet ensemble de données pour le moment). Riz ⁶ Les données A-seq proviennent de la base de données Gene Expression Omnibus (GEO), numéro GSE135549 . Les données m6ACE-Seq et miCLIP de la lignée cellulaire humaine HEK293T sont disponibles dans la base de données GEO sous les numéros d'accès GSE124509 et GSE63753 . Le MeRIP-seq de la lignée cellulaire humaine K562 est disponible dans la base de données GEO sous le numéro d'accès GSE205709 . Quatre ensembles de données de transcriptome apparent in vitro (IVET), deux ensembles de données IVT à partir de séquences synthétiques et deux ensembles de données de riz générés par séquençage direct de l'ARN à l'ONT ont été déposés dans la base de données GEO sous les numéros d'accès GSE227087 .