Xaira Therapeutics stellt Largest Perturb-seq-Datensatz vor

X-Atlas/Orion: Xaira Therapeutics präsentiert größte öffentlich verfügbare Genome-wide Perturb-seq-Datensammlung für die nächste Generation von KI in der Biologie SOUTH SAN FRANCISCO, Kalifornien – Xaira Therapeutics hat heute einen bedeutenden Schritt voran gemacht, indem sie „X-Atlas/Orion“ veröffentlichte, die größte öffentlich verfügbare Perturb-seq-Atlas-Datensammlung. Diese umfangreiche Datensammlung wurde durch die gleichzeitige Einführung der „Fix-Cryopreserve-ScRNAseq“ (FiCS) Perturb-seq-Plattform ermöglicht, einer hochskalierbaren Technologie zur Erzeugung großer Datenmengen. Diese kombinierten Fortschritte sollen den Entwicklungsprozess von biologischen Grundmodellen beschleunigen und neue Bereiche der biologischen Forschung und Therapieentwicklung erschließen. Der rasante Fortschritt der Single-Cell-Technologie hat die Entwicklung von Grundmodellen angeregt, die komplexe biologische Prozesse entschlüsseln sollen. Obwohl diese Modelle großes Potenzial bieten, um künstlich intelligente virtuelle Zellen zu schaffen, wurden ihre Weiterentwicklungen bisher durch den Mangel an großen, hochwertigen Stördaten behindert. Die FiCS Perturb-seq-Plattform von Xaira, die auf der Chromium-Plattform von 10x Genomics basiert, bietet die Sensibilität, Skalierbarkeit und Reproduzierbarkeit, die für die Erzeugung hochwertiger Stördaten unerlässlich sind. Xairas innovativer Ansatz löst logistische Herausforderungen bei der Profilierung großer Zellmengen, erfasst genaue transcriptomische Veränderungen infolge von Störungen und vervollständigt bekannte biologische Wege und Proteinkomplexe. Der X-Atlas/Orion-Datensatz besteht aus 8 Millionen Zellen und zielt auf alle menschlichen Protein-codierenden Gene ab, wobei mehr als 16.000 eindeutige molekulare Identifikatoren (UMIs) pro Zelle vertieft sequenziert werden. Dies ermöglicht die Entdeckung biologischer Phänotypen aus einem breiten Spektrum genetischer Störungen. Ein wichtiger Fortschritt ist Xairas Methode zur Detektion dosisabhängiger genetischer Effekte, eine präzisere Art, zu verstehen, wie sich die Genaktivität mit der Intensität einer gegebenen Intervention ändert. Traditionell haben Wissenschaftler Perturb-seq-Genknockdowns als einen „An“- oder „Aus“-Schalter betrachtet. Die Xaira-Wissenschaftler zeigten jedoch, dass die Menge des in jeder Zelle detektierten einzelnen Leit-RNAs (sgRNA) verwendet werden kann, um zu messen, wie stark ein Gen unterdrückt wird. Dies bietet ein detaillierteres Bild der genetischen Funktion und verbessert das Vorhersagevermögen und die biologische Einsicht zukünftiger kausaler Modelle, indem die Stärke der Störung als kontinuierliche Variable integriert wird. „Diese industrielle Plattform und der Orion-Datensatz verleihen Wissenschaftlern die Möglichkeit, prädiktivere Modelle komplexer Biologie zu erstellen“, sagte Ci Chu, Vice President of Early Discovery bei Xaira und Senior-Autor des Vorschriftdrucks. „Wir glauben, dass dies uns helfen wird, die Biologie von Krankheiten besser zu verstehen und Arzneimittelziele zu entdecken.“ Bo Wang, SVP und Head of Biomedical AI bei Xaira Therapeutics, fügte hinzu: „Diese Plattform bietet die Skalierbarkeit und Qualität, die notwendig sind, um zu modellieren, wie Zellen auf verschiedenen Bedingungen reagieren. Dies ist ein entscheidender Schritt zur Schulung der ersten Generation virtueller Zellmodelle. Mit dieser Basis sind wir besser gerüstet, um Krankheitsmechanismen aufzudecken und intelligenter therapeutisch vorgehen zu können.“ Dieses Publikationsschlaglicht krönt ein erfolgreiches Jahr für Xaira seit ihrer Gründung im April 2024. Im Oktober 2024 erhielt Dr. David Baker, Co-Gründer von Xaira, zusammen mit Dr. Demis Hassabis und Dr. John Jumper von Google DeepMind den Nobelpreis für Chemie für bahnbrechende KI-getriebene Fortschritte in der Proteinstrukturvorhersage und dem Design neuer Proteine. Das Xaira-Team arbeitet daran, diese Modelle weiterzuentwickeln und neue Methoden zu schaffen, die den Bereich der biologischen Ziele und der konstruierten Moleküle mit der menschlichen Erkrankungserfahrung verbinden. Zugang zum Datensatz: X-Atlas/Orion ist jetzt öffentlich verfügbar hier: https://doi.org/10.25452/figshare.plus.29190726 Lesen Sie den Vorschriftdruck: FiCS Perturb-seq und X-Atlas/Orion-Publikation: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.06.11.659105v1 Über Xaira Therapeutics Xaira Therapeutics ist ein integrierter Biotechnologieunternehmen, das Fortschritte in der Künstlichen Intelligenz antreibt, um die Sprache des Lebens zu lernen und die Behandlung von Krankheiten zu revolutionieren. Das Unternehmen strebt an, den Prozess der Arzneimittelerforschung und -entwicklung von Anfang bis Ende neu zu denken, indem es führende Talente in drei Kernbereichen vereint: Maschinelles Lernen zur besseren Verständnis der Biologie, umfangreiche DatenGenerierung zur Antriebskraft neuer Modelle und robuste therapeutische Produktentwicklung zur Behandlung von Krankheiten. Xaira hat seinen Hauptsitz im San Francisco Bay Area. In der Branche wird die Veröffentlichung von X-Atlas/Orion als Meilenstein betrachtet. Experten sehen in der Datensammlung ein großes Potenzial, um die Forschung und Entwicklung von Therapien zu beschleunigen und die Vorhersagegenauigkeit von biologischen Modellen zu verbessern. Xaira Therapeutics, bekannt für seine pionierhafte Arbeit in der KI-getriebenen Biowissenschaft, hat sich in kurzer Zeit etabliert und macht wichtige Beiträge zur Medizin. Die Fähigkeit, dosisabhängige genetische Effekte zu erfassen, wird besonders als eine Schlüsselinnovation angesehen, die die Genauigkeit und Tiefe der biologischen Analysen erheblich steigert.