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6일 전

JAM-2: 고도로 계산 기반의 약물 유사 항체의 설계 및 높은 성공률

Nabla Bio

JAM-2: 고도로 계산 기반의 약물 유사 항체의 설계 및 높은 성공률

초록

우리는 VHH-Fc 및 전장 단일클론 항체(mAb)의 약물 유사 결합력과 개발 가능성(Developability)을 처음으로 달성하면서도, 예전에는 달성하기 어려웠던 높은 수준의 타겟 및 에피토프 범위를 구현한 일반 목적의 de novo 단백질 설계 시스템 JAM-2를 제시한다. 16개의 새로운 타겟에 대해 JAM-2는 100%의 타겟에 대해 결합체를 생성하였으며, 평균 성공률은 VHH-Fc 형식에서 39%, mAb 형식에서 18%를 기록했다. 각 형식당 단지 45개의 설계만을 사용함으로써, 절반의 타겟에서 피코모르 또는 일자리 나노모르 수준의 결합력을 가진 결합체를 도출하였다. 또 다른 10개의 타겟(각각 20개의 사용자 지정 에피토프 포함)에 대해서는, 절반의 타겟에 대해 30~70%의 에피토프에 대해 VHH-Fc 결합체를 생성하였다. 놀랍게도 JAM-2는 CXCR4 및 CXCR7과 같은 GPCR 단백질을 생리적 세포 환경에서 직접 타겟으로 하여 각각 11.7%와 3.8%의 성공률로 항체 결합체를 생성하였으며, 최고 수준의 설계는 일자리 나노모르 수준의 결합력을 달성하였다. 수백 개의 de novo 설계에 대한 개발 가능성 프로파일링(Developability Profiling)은 계산 기반 설계 생물의학제제에 있어 가장 큰 개발 가능성 데이터셋을 구성하였으며, 그 중 절반 이상이 핵심 산업 기준을 충족하였고, 많은 최고 수준의 설계는 추가 최적화 없이도 리드 품질의 프로파일을 보였다. 이러한 결과는 JAM-2가 현재까지 가장 최첨단의 de novo 항체 설계 시스템임을 입증하며, 기존의 발견 전략을 따라가거나 이를 능가하는, 약물 개발 현장에서 바로 활용 가능한 첫 번째 시스템으로서의 위치를 확보하였다.

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