10일 전
IntFold: 일반적 및 특화된 생물분자 구조 예측을 위한 제어 가능한 기반 모델
The IntFold Team, Leon Qiao, Wayne Bai, He Yan, Gary Liu, Nova Xi, Xiang Zhang

초록
우리는 일반적인 생물분자 구조 예측뿐만 아니라 전문적인 생물분자 구조 예측을 위한 제어 가능한 기초 모델인 IntFold를 소개합니다. IntFold는 최신의 AlphaFold3와 비교할 수 있는 예측 정확성을 보여주면서도, 우수한 맞춤형 주의 커널(attention kernel)을 활용합니다. 표준 구조 예측을 넘어서, IntFold는 개별 어댑터를 사용하여 알로스테릭 상태, 제약 구조, 그리고 결합 친화력을 예측하는 데 적응할 수 있습니다. 또한, 우리는 항체-항원 복합체와 같은 도전적인 대상에 대해 더 세밀한 평가를 제공하는 도킹 품질 추정을 위한 새로운 신뢰성 헤드(confidence head)를 소개합니다. 마지막으로, 이 계산적으로 집약적인 모델의 학습 과정에서 얻은 통찰력을 공유합니다.