2달 전

FABind+: 개선된 주머니 예측 및 포즈 생성을 통한 분자 도킹 강화

Kaiyuan Gao; Qizhi Pei; Gongbo Zhang; Jinhua Zhu; Kun He; Lijun Wu
FABind+: 개선된 주머니 예측 및 포즈 생성을 통한 분자 도킹 강화
초록

분자 도킹은 약물 발견 과정에서 중요한 역할을 하는 절차입니다. 전통적인 기술들은 물리 원칙에 기반한 광범위한 샘플링과 시뮬레이션에 의존하지만, 이러한 방법들은 종종 느리고 비용이 많이 듭니다. 딥 러닝 기반 접근법의 등장은 정확성과 효율성 모두를 향상시키는 데 큰 잠재력을 보여주었습니다. 속도와 정확성을 중점으로 설계된 모델 FABind의 기초 연구를 바탕으로, 우리는 성능을 크게 향상시킨 개선된 버전인 FABind+를 소개합니다. 우리는 분자 도킹에서 주머니 예측이 중요한 병목 현상임을 확인하고, 이 문제를 크게 개선하여 도킹 과정을 간소화하는 새로운 방법론을 제안합니다. 또한, 포즈 생성 능력을 향상시키기 위해 도킹 모듈에 수정을 가하였습니다. 전통적인 샘플링/생성 방법과의 격차를 줄이기 위해, 우리는 회귀 프레임워크에 미세 조정만 필요한 단순하면서도 효과적인 샘플링 기술과 신뢰도 모델을 통합하였습니다. 실험 결과 및 분석은 FABind+가 원래 FABind보다 뛰어난 성능을 보이며, 최신 수준의 경쟁력 있는 성능을 달성하고, 유익한 모델링 전략을 제공함을 밝혀냈습니다. 이는 FABind+가 분자 도킹과 약물 발견 분야에서 실질적인 발전을 대표한다는 것을 입증합니다. 우리의 코드는 https://github.com/QizhiPei/FABind 에서 확인할 수 있습니다.

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