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il y a 16 jours

Découvrez Spinky : une boîte à outils open-source pour la détection des spindle et des complexes K, validée sur l’archive open-access des études du sommeil de Montréal (MASS).

{Sonia Frenette, Pierre-Emanuel Aguera, Sahbi Ch1aibi, Christian O'Reilly, Karim Jerbi, Jb Eichenlaub, Etienne Combrisson, Abdennaceur Kachouri, Perrine Ruby, Mounir Samet, Julie Carrier, Tarek Lajnef}
Découvrez Spinky : une boîte à outils open-source pour la détection des spindle et des complexes K, validée sur l’archive open-access des études du sommeil de Montréal (MASS).
Résumé

Les spindle et les complexes K constituent parmi les micro-événements les plus marquants observés dans les enregistrements électroencéphalographiques (EEG) pendant le sommeil. Ces micro-structures EEG sont considérées comme des marqueurs caractéristiques des processus cognitifs liés au sommeil. Bien que leur identification et leur quantification soient fastidieuses et chronophages, elles revêtent une importance cruciale dans les études du sommeil, tant chez des sujets sains que chez des patients souffrant de troubles du sommeil. Par conséquent, des méthodes automatisées de détection des spindle et des complexes K pourraient offrir un appui précieux aux chercheurs et aux cliniciens. Récemment, nous avons proposé un cadre de détection conjointe des spindle et des complexes K (Lajnef et al., 2015a), fondé sur la Transformée en ondelettes à facteur Q ajustable (TQWT ; Selesnick, 2011a) et l’analyse des composantes morphologiques (MCA). À l’aide d’un large éventail de métriques de performance, cet article fournit une validation critique et une référence comparative de l’approche proposée, en l’appliquant à des données EEG accessibles au public issues de l’Archives de l’Étude du Sommeil de Montréal (MASS ; O’Reilly et al., 2014). De façon particulièrement significative, les résultats obtenus ont été comparés à ceux de méthodes alternatives déjà testées sur la même base de données. En ce qui concerne la détection des spindle, notre méthode a atteint des performances supérieures à la plupart des méthodes alternatives. Ces résultats ont été confirmés par des tests statistiques tenant compte à la fois de la sensibilité et de la précision (à savoir le coefficient de corrélation de Matthew (MCC), le score F1 et le kappa de Cohen). La méthode proposée est désormais mise à disposition de la communauté scientifique via un outil open-source intitulé Spinky (pour la détection des spindle et des complexes K). Grâce à son interface graphique (GUI) et à son accès aux ressources Matlab et Python, Spinky devrait contribuer à une approche de la science ouverte, favorisant ainsi la reproductibilité et des comparaisons fiables des performances des classificateurs pour la détection des micro-structures EEG du sommeil, tant chez les sujets sains que chez les patients.

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