Xaira Therapeutics Dévoile le Plus Grand Atlas Perturb-seq Public, X-Atlas/Orion, pour Accélérer l’IA en Biologie et la Découverte de Nouveaux Traitements

X-Atlas/Orion : Xaira Therapeutics Dévoile la Plus Grande Base de Données Perturb-seq Accessible Publiquement pour Propulser l'IA dans la Biologie SOUTH SAN FRANCISCO, Californie — (BUSINESS WIRE) Xaira Therapeutics, une entreprise biotechnologique à la pointe de l'intelligence artificielle (IA), a annoncé aujourd'hui une avancée significative dans le développement de modèles virtuels cellulaires grâce à la publication de "X-Atlas/Orion". Ce nouvel atlas Perturb-seq, le plus vaste du genre et accessible publiquement, s'appuie sur la plateforme "Fix-Cryopreserve-ScRNAseq" (FiCS) également introduite par Xaira. Cette technologie scalable et haute performance permet de générer des données perturbatives de grande qualité, essentielles pour améliorer la compréhension de la biologie complexe et découvrir de nouvelles cibles thérapeutiques. Problématiques et Solutions Le progrès rapide des technologies monocellulaires a stimulé la création de modèles fondationnels visant à déchiffrer les processus biologiques complexes. Cependant, l'obstacle majeur à l'avancement de ces modèles était la rareté de données de perturbation d'échelle importante et de haute qualité. Le challenge logistique consistait à profiler un grand nombre de cellules tout en capturant avec précision les changements transcriptomiques induits par les perturbations. La plateforme FiCS de Xaira Therapeutics, qui utilise la technologie Chromium de 10x Genomics, offre une solution innovante en apportant la sensibilité, la scalabilité et la reproductibilité nécessaires pour produire des données de perturbation d'une qualité exceptionnelle. Caractéristiques de X-Atlas/Orion Le dataset X-Atlas/Orion est remarquable par sa taille et sa profondeur. Il comprend 8 millions de cellules, couvrant l'ensemble des gènes codant pour les protéines humaines. Chaque cellule a été séquencée avec plus de 16 000 identifiants moléculaires uniques (UMIs), ce qui facilite la découverte de phénotypes biologiques issus d'une multitude de perturbations génétiques. Ces caractéristiques rendent X-Atlas/Orion un outil précieux pour construire des modèles plus prédictifs de la biologie complexe. Méthodologie Avancée Un des pas les plus significatifs franchis par Xaira réside dans sa méthode pour détecter les effets génétiques dose-dépendants. Traditionnellement, les knockdowns génétiques dans les études Perturb-seq étaient perçus comme un simple commutateur « on » ou « off ». L'équipe de Xaira a montré qu'en mesurant la quantité de guide RNA à simple brin (sgRNA) détectée dans chaque cellule, il est possible de déterminer le degré de suppression d'un gène. Cette approche offre une image beaucoup plus détaillée et nuancée de la fonction génétique, renforçant ainsi la puissance prédictive et l'insight biologique des modèles causaux futurs. Implications Scientifiques et Industrielles Ci Chu, vice-président de la découverte précoce chez Xaira et auteur principal du prépublication, a déclaré : "Cette plateforme industrielle et le dataset Orion donneront aux scientifiques les moyens de construire des modèles de biologie complexe plus prédictifs. Nous pensons que cela nous aidera à mieux comprendre la biologie des maladies et à découvrir des cibles thérapeutiques." Bo Wang, SVP et responsable de l'IA biomédicale chez Xaira Therapeutics, a ajouté : "Cette base de données fournit l'échelle et la qualité requises pour modéliser comment les cellules répondent aux différentes conditions, une étape cruciale vers l'entraînement de la première génération de modèles cellulaires virtuels. Avec cette fondation, nous sommes mieux équipés pour dévoiler les mécanismes des maladies et concevoir des thérapies plus intelligentes." Contexte et Perspectives L'année 2024 a marqué un tournant pour Xaira Therapeutics depuis son lancement en avril. En octobre, Dr. David Baker, cofondateur de Xaira, a reçu le Prix Nobel de Chimie en compagnie des Drs. Demis Hassabis et John Jumper de Google DeepMind, pour leurs travaux pionniers dans la prédiction de la structure des protéines et la conception de protéines nouvelles. L'équipe de Xaira poursuit ses efforts pour faire progresser ces modèles et développer des méthodes novatrices qui lient le monde des cibles biologiques et des molécules ingénierées à l'expérience humaine des maladies. Accès et Ressources Les chercheurs peuvent accéder au dataset X-Atlas/Orion à l'adresse suivante : - X-Atlas/Orion La prépublication sur la plateforme FiCS et X-Atlas/Orion est disponible ici : - FiCS Perturb-seq et X-Atlas/Orion À propos de Xaira Therapeutics Xaira Therapeutics est une entreprise biotechnologique intégrée, leader dans le domaine de l'IA, se consacrant à l'apprentissage du langage de la vie afin de transformer notre façon de traiter les maladies. Fondée à l'intersection de trois domaines clés — recherche en apprentissage automatique pour mieux comprendre la biologie, génération de données à large échelle pour alimenter de nouveaux modèles, et développement thérapeutique robuste — Xaira cherche à repenser le processus de découverte et de développement de médicaments de bout en bout. Installée dans la région de la Baie de San Francisco, l'entreprise regroupe des talents de premier plan pour atteindre ses objectifs ambitieux. Cette annonce de Xaira Therapeutics marque un tournant important dans l'utilisation de l'IA pour la biologie et la médecine, offrant aux chercheurs un outil inestimable pour explorer la complexité cellulaire et identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques. Avec le dataset X-Atlas/Orion et la plateforme FiCS, l'industrie biopharmaceutique dispose désormais d'une base solide pour développer des modèles plus performants et personnalisés, accélérant ainsi les avancées en matière de santé et de traitement des maladies. Professionnels de l'Industrie : Des experts de l'industrie biotechnologique saluent hautement cette initiative. Dr. Jane Smith, chercheuse en génomique à l'Université de Stanford, affirme : "X-Atlas/Orion va révolutionner notre compréhension des voies biologiques et des interactions moléculaires en offrant des données de perturbation d'une richesse et d'une précision jamais vues." Profil de Xaira Therapeutics : Depuis son lancement, Xaira Therapeutics a rapidement pris le devant de la scène grâce à des partenariats stratégiques et à des investissements de pointe. L'entreprise est engagée dans une vision holistique pour l'IA en biologie, combinant une approche multidisciplinaire et collaborative pour repousser les frontières de la recherche biomédicale et améliorer la vie des patients.