Outil d'IA pour l'analyse de fragments d'ADN sanguin : une méthode rapide et abordable pour surveiller le cancer

Résumé : Nouvelle méthode d'IA pour une surveillance du cancer plus rapide et abordable Présentation En mars 2025, des scientifiques du ASTAR Genome Institute of Singapore (ASTAR GIS) ont publié dans Nature Biomedical Engineering une étude révolutionnaire consacrée à une nouvelle méthode basée sur l'intelligence artificielle (IA), appelée "Fragle". Cette technique permet une surveillance plus rapide et plus abordable du cancer grâce à des prélèvements sanguins simples, en analysant la taille des fragments d'ADN présents dans le sang pour en identifier les motifs distinctifs. Ces patterns permettent aux médecins de suivre l'évolution des traitements de manière plus précise et à des intervalles plus fréquents. Contexte et problématique des méthodes existantes Les méthodes actuelles de mesure de l'ADN tumoral circulant (ctDNA) dans le sang nécessitent généralement des séquençages d'ADN complexes et coûteux, visant à détecter des mutations communes du cancer. Comme ces mutations varient d'un patient à l'autre, les résultats des tests peuvent être incohérents, compliquant ainsi la surveillance de l'efficacité des traitements de cancer au moyen des prélèvements sanguins. Développement et fonctionnement de Fragle Fragle utilise le pouvoir de l'IA pour analyser la taille des fragments d'ADN présents dans le sang. L'ADN issu des cellules cancéreuses présente des motifs de taille différents de ceux de l'ADN sain. Grâce à cette capacité à distinguer les profils spécifiques du ctDNA, l'IA peut identifier les traces de cancer même en utilisant de très petites quantités d'ADN. Ceci rend la méthode Fragle non seulement plus rapide mais aussi moins coûteuse, facilitant la surveillance continue de la maladie. Résultats et fiabilité de Fragle L'étude montre que Fragle est très fiable. Elle a fourni des résultats précis sur des centaines d'échantillons sanguins provenant de patients atteints de différents types de cancers. La méthode est également polyvalente et peut être intégrée à la plupart des techniques de profilage de l'ADN couramment utilisées dans les hôpitaux ou proposées par les fournisseurs commerciaux. Cette flexibilité pourrait faciliter son adoption widespread dans les pratiques cliniques. Avantages de Fragle Simplicité et rapidité : Fragle ne nécessite qu'un petit échantillon de sang, ce qui le rend moins invasif et plus facile à réaliser. Abordabilité : En évitant les techniques complexes et coûteuses de séquençage, Fragle offre une solution plus abordable. Fiabilité : Des tests effectués sur de nombreux échantillons de différents types de cancers ont montré que Fragle est capable de livrer des résultats précis et cohérents. Accessibilité : La méthode est compatible avec la plupart des techniques de profilage de l'ADN déjà utilisées, ce qui facilite son intégration dans les flux de travail cliniques existants. Prospectives de recherche et d'application L'équipe de recherche, dirigée par le Dr Anders Skanderup, Senior Principal Scientist au Laboratoire de Génomique du Cancer Computationnelle de l'A*STAR GIS, compare le concept de Fragle à celui du suivi des épidémies de COVID-19 par la détection de particules virales dans les eaux usées. "Nous voulions développer une approche plus simple, plus abordable et plus accessible, capable de soutenir une surveillance précise sans ajouter de contraintes aux procédures cliniques," explique-t-il. Les chercheurs envisagent également d'améliorer la sensibilité de Fragle pour détecter des niveaux encore plus faibles de ctDNA, ce qui serait crucial pour détecter les rechutes précocement chez les patients atteints de cancer. Collaborations et études en cours Le A*STAR GIS collabore activement avec le National Cancer Center Singapore (NCCS) pour identifier les opportunités cliniques et les applications possibles de Fragle. Le Professeur Associé Daniel Tan, consultant senior de l'Oncomedicine à l'NCCS et co-auteur de l'étude, exprime son enthousiasme quant à l'utilisation de Fragle : "Nous sommes très impatients de lancer des études pour voir comment Fragle peut détecter les rechutes plus tôt chez les patients atteints de cancer du poumon locaux." Une étude en cours impliquant plus de 100 patients inscrits dans des essais cliniques utilise Fragle pour surveiller les niveaux de ctDNA tous les deux mois pendant leur traitement. L'objectif est de détecter les signes de rechute avant qu'ils n'apparaissent sur des examens de routine, ainsi que d'évaluer si les changements précoce dans les niveaux de ctDNA peuvent prédire les réponses favorables ou défavorables aux traitements. Cette étude vise à évaluer la valeur d'une intégration des tests de ctDNA dans le suivi systématique des patients atteints de cancer pendant leur traitement. Évaluation par les professionnels et profil de l'entreprise Les professionnels de l'industrie saluent l'innovation apportée par Fragle. Dr Wan Yue, Directrice Exécutive du A*STAR GIS, exprime ainsi la vision de l'institut et son espoir que cette recherche puisse améliorer le suivi et les traitements du cancer, non seulement à Singapour mais aussi à l'échelle mondiale. "Nous sommes très enthousiastes quant au potentiel de Fragle pour aider nos professionnels de santé à détecter et à suivre le cancer plus précisément, ainsi que pour surveiller les traitements plus efficacement. Notre objectif est de traduire cette recherche génomique afin de benefit la santé de la population, tant à Singapour que partout dans le monde." Le A*STAR GIS est un institut de renommée mondiale spécialisé dans la recherche génomique et biologique. Il collabore régulièrement avec des institutions de santé et des entreprises privées pour traduire ses découvertes en applications pratiques, améliorant ainsi considérablement la qualité des soins de santé. Fragle représente un pas significatif dans cette direction, promettant une surveillance cancéreuse plus précise et plus adaptée à la pratique clinique quotidienne.