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VenusMutHub 단백질 돌연변이 소규모 샘플 데이터 세트

날짜

8달 전

크기

1.85 MB

기관

상하이 교통대학교

라이선스

MIT

* 이 데이터 세트는 온라인 사용을 지원합니다.여기를 클릭하여 이동하세요.

VenusMutHub는 상하이 교통대학교 홍량 교수팀이 2025년에 발표한 단백질 돌연변이 엔지니어링 AI 모델을 평가하는 새로운 벤치마크입니다. 관련 논문 결과는 다음과 같습니다.VenusMutHub: 소규모 실험 데이터에 대한 단백질 돌연변이 효과 예측 인자의 체계적 평가", 해당 연구는 Acta Pharmaceutica Sinica B 저널에 게재되었습니다.

VenusMutHub는 실제 응용 시나리오를 위한 단백질 돌연변이의 최초의 소규모 샘플 데이터 세트입니다. 연구팀은 실제 적용 시나리오를 위해 527개 단백질(그 중 98% 단백질은 5~200개의 돌연변이를 가짐)을 포함하는 905개의 소규모 샘플 실험 돌연변이 데이터 세트를 신중하게 편집했으며, 안정성, 활성, 결합 친화도 및 선택성과 같은 다양한 기능적 측정 데이터를 포함했습니다. 모든 데이터는 대체 형광 판독법이 아닌 직접적인 생화학적 측정법을 사용하여 얻었으므로 평가의 정확성이 보장됩니다.

또한 연구팀은 단백질 서열, 3차원 구조, 진화 정보를 활용하는 다양한 방법을 망라하는 23개의 최첨단 계산 모델(AI 모델과 비AI 모델)을 테스트하고 실제 적용 시나리오에서 소규모 샘플 데이터에 대한 이러한 모델의 예측 능력을 종합적으로 평가했습니다.

오픈 리소스로서 VenusMutHub는 계속 업데이트될 것입니다.https://lianglab.sjtu.edu.cn/muthub/), 해당 분야의 신뢰할 수 있는 벤치마크를 제공하고, 보다 표준화되고 빠른 개발을 향해 단백질 기능 예측을 촉진합니다.

VenusMutHub.torrent
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  • VenusMutHub/
    • README.md
      1.97 KB
    • README.txt
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      • data/
        • VenusMutHub.zip
          1.85 MB

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