STARmap&MERFISH 마우스 세포-유전자 쌍 데이터 세트

이 데이터 세트는 논문에서 가져온 것입니다.세포-세포 상호작용 인식 세포 임베딩을 통한 단일 세포 해상도 공간 전사체 데이터에서 조직 모듈 발견", 사용된 마우스 세포-유전자 쌍 데이터 세트 두 개: MERFISH 마우스 데이터 세트와 STARmap 마우스 데이터 세트.

이 연구에서는 두 가지 데이터 세트를 사전 처리했습니다.

• STARmap 마우스 PLA 데이터 세트의 경우, 정규화된 세포-유전자 행렬은 원래 논문에서 제공되었으며 로그 변환되었습니다.

• MERFISH 마우스 AB 데이터 세트의 경우, 유전자 개수 행렬은 CELL x GENE 라이브러리에서 얻었습니다. 세포당 총 개수는 10,000으로 정규화되었고, 정규화된 세포-유전자 행렬은 로그 변환되었습니다.